ขอบเขตการวิเคราะห์
ขอบเขตทั้งหมด รวมถึงจุดที่มันสิ้นสุด
ทุกอย่างด้านล่างคือการวิเคราะห์ข้อมูลที่คุณมีอยู่แล้ว เราไม่ทำงานห้องปฏิบัติการเปียก และไม่ขายต่อบริการหาลำดับเบส
Single-cell / single-nucleus RNA-seq
จากเมทริกซ์นับสู่กลุ่มประชากรที่กำกับชนิดแล้ว
รับผลลัพธ์จาก Cell Ranger, ไฟล์ AnnData .h5ad, ออบเจกต์ Seurat หรือเมทริกซ์ธรรมดา
- การจัดการหยดว่างและ doublet การแก้ไข ambient RNA
- ค่าตัด QC รายชุดข้อมูล พร้อมแสดงเหตุผลประกอบ
- การจัดกลุ่มครอบคลุมช่วงความละเอียด ไม่ใช่เดาค่าเดียว
- การกำกับชนิดเซลล์ทั้งอัตโนมัติและด้วยคน ตรวจสอบกับยีน marker
- การแสดงออกที่แตกต่างระหว่างกลุ่ม รวมข้อมูลขึ้นสู่ระดับตัวอย่าง
- การให้คะแนนชุดยีนและวิถีสัญญาณ
Spatial transcriptomics
ทั้งแบบอิงการหาลำดับเบสและแบบอิงภาพถ่าย
Visium และ Visium HD, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH
- QC ระดับ spot และเซลล์ การตรวจหาบริเวณเนื้อเยื่อ การจัดตำแหน่งภาพ
- การระบุโดเมนเชิงพื้นที่
- ยีนที่แปรผันตามตำแหน่ง
- การทำ deconvolution เทียบชุดอ้างอิง single-cell ที่สอดคล้อง
- สถิติความเป็นเพื่อนบ้านและการอยู่ร่วมตำแหน่ง
- ภาพซ้อนทับบนภาพ H&E หรือภาพอิมมูโนฟลูออเรสเซนซ์
Bulk RNA-seq
การแสดงออกที่แตกต่างซึ่งผ่านการประเมินได้
- รับข้อมูลจากค่านับ หรือจาก FASTQ ผ่านไปป์ไลน์การวัดปริมาณมาตรฐาน
- เขียนแบบแผนการทดลองและคู่เปรียบเทียบก่อนทดสอบทางสถิติ
- การจัดการตัวแปรร่วมและ batch
- การวิเคราะห์การเพิ่มพูนแบบ GO, KEGG และ GSEA
- รูป volcano, heatmap, PCA และรูปรายยีน เป็นไฟล์เวกเตอร์
โมดูลข้ามประเภท
โมดูลที่เสริมเข้ากับข้อใดข้างต้นก็ได้
- การรวมข้อมูลหลายตัวอย่าง พร้อมการตรวจสอบการแก้ไขเกินจำเป็น
- ความแตกต่างของสัดส่วนเซลล์ระหว่างเงื่อนไข
- Trajectory และ pseudotime
- การสื่อสารระหว่างเซลล์
- การวิเคราะห์ร่วมของ CITE-seq และ multiome (RNA + ATAC)
- การวิเคราะห์ชุดข้อมูลสาธารณะควบคู่กับข้อมูลของคุณ
นอกขอบเขต
สิ่งที่เราจะบอกตรง ๆ ว่าทำให้ไม่ได้
งานห้องปฏิบัติการเปียก
ไม่รับเตรียมตัวอย่าง สร้างไลบรารี หรือหาลำดับเบส หากคุณต้องการสิ่งเหล่านี้ ให้ใช้ผู้ให้บริการรายเดิมต่อไป เราทำงานต่อจากสิ่งที่เขาส่งกลับมา
รายงานทางคลินิกหรือการวินิจฉัย
ผลงานของเราใช้เพื่อการวิจัย เราไม่ออกการแปลผลเชิงวินิจฉัย และไม่มีสิ่งใดที่เราส่งมอบเป็นเครื่องมือแพทย์
ข้อสรุปที่คุณเลือกไว้แล้ว
หากข้อมูลไม่สนับสนุนการเปรียบเทียบนั้น รายงานก็จะเขียนเช่นนั้น การได้ยินจากเรานั้นถูกกว่าการได้ยินจากผู้ประเมิน
ไม่แน่ใจว่าตรงกับงานของคุณหรือไม่ ส่งคำอธิบายข้อมูลและคำถามมาได้เลย หากอยู่นอกสิ่งที่เราถนัด เราจะบอกในคำตอบ แทนที่จะเสนอราคาให้
บอกเราว่าคุณมีอะไรอยู่
ประเภทข้อมูล ขนาดคร่าว ๆ และการเปรียบเทียบที่ต้องการ เท่านี้ก็พอสำหรับออกขอบเขตงานและราคา