Skop analisis
Skop penuh, termasuk di mana ia berhenti.
Semua di bawah ialah analisis data yang sudah ada pada anda. Kami tidak menjalankan kerja makmal basah, dan kami tidak menjual semula penjujukan.
RNA-seq sel tunggal / nukleus tunggal
Daripada matriks kiraan kepada populasi yang beranotasi
Menerima keluaran Cell Ranger, fail AnnData .h5ad, objek Seurat, atau matriks biasa.
- Pengendalian titisan kosong dan doublet, pembetulan RNA ambien
- Ambang QC bagi setiap set data, berserta sebabnya
- Pengelompokan merentas julat resolusi, bukan satu tekaan tunggal
- Anotasi jenis sel automatik dan manual, disahkan terhadap gen penanda
- Ekspresi berbeza diagregatkan ke peringkat sampel untuk perbandingan kumpulan
- Pemarkahan set gen dan laluan biologi
Transkriptomik spatial
Berasaskan penjujukan dan berasaskan pengimejan
Visium dan Visium HD, Stereo-seq, Xenium, CosMx, MERFISH.
- QC spot dan sel, pengesanan tisu, pendaftaran imej
- Pengenalpastian domain spatial
- Gen berubah mengikut ruang
- Dekonvolusi terhadap rujukan sel tunggal yang sepadan
- Statistik kejiranan dan ko-lokalisasi
- Tindanan pada imej H&E atau imunopendarfluor
RNA-seq pukal
Ekspresi berbeza yang bertahan semasa penilaian
- Terima daripada kiraan, atau daripada FASTQ melalui saluran kuantifikasi standard
- Reka bentuk dan kontras ditulis sebelum pengujian
- Pengendalian kovariat dan kelompok
- Pengayaan GO, KEGG dan GSEA
- Panel volcano, heatmap, PCA dan setiap gen dalam fail vektor
Modul merentas
Modul yang boleh ditambah pada mana-mana di atas
- Integrasi berbilang sampel dengan semakan pembetulan berlebihan
- Perbezaan kelimpahan antara keadaan
- Trajektori dan pseudotime
- Komunikasi antara sel
- Analisis bersama CITE-seq dan multiome (RNA + ATAC)
- Analisis semula set data awam bersama data anda
Di luar skop
Perkara yang akan kami beritahu kami tidak boleh buat.
Kerja makmal basah
Tiada penyediaan sampel, pembinaan pustaka atau penjujukan. Jika anda perlukannya, kekalkan pembekal anda — kami bekerja dengan apa sahaja yang mereka pulangkan.
Laporan klinikal atau diagnostik
Keluaran kami untuk penyelidikan. Kami tidak mengeluarkan tafsiran diagnostik dan tiada apa yang kami hantar merupakan peranti perubatan.
Kesimpulan yang sudah anda pilih
Jika data tidak menyokong perbandingan itu, itulah yang akan tertulis dalam laporan. Lebih murah mendengarnya daripada kami berbanding daripada pewasit.
Tidak pasti ia sesuai? Hantar penerangan data dan soalan anda. Jika ia di luar bidang yang kami kuasai, kami akan katakan begitu dalam balasan, bukannya memberi sebut harga.
Beritahu kami apa yang ada pada anda.
Jenis data, anggaran saiz, dan perbandingan yang ingin dibuat. Itu sudah cukup untuk skop dan harga.