Apa ini
Pasukan bioinformatik yang boleh anda upah untuk satu projek.
Kebanyakan kumpulan penyelidikan tidak perlukan seorang lagi pakar bioinformatik sepenuh masa. Mereka perlukan satu set data ditukar menjadi keputusan, pada tarikh yang boleh dirancang.
- Tiada kontrak penjujukan
Kekalkan pembekal penjujukan anda
Kami tidak menjual penjujukan, jadi kami tidak pernah menuntut anda membelinya daripada kami. Bawa data dari mana-mana platform, mana-mana pembekal, atau set data awam.
- Tiada pesanan minimum
Satu sampel pun projek yang sah
Begitu juga satu slaid, atau satu komen pewasit yang memerlukan panel yang anda tiada masa untuk sediakan.
- Tiada caj ikut jam
Harga dipersetujui sebelum kami mula
Jika data ternyata berbeza daripada yang diterangkan, kami beri sebut harga baharu dan tunggu jawapan anda — kami tidak menambahnya pada invois selepas itu.
Skop analisis
Transkriptomik, dalam tiga bentuk yang benar-benar sampai ke tangan anda.
RNA-seq sel tunggal
QC dan penapisan, pengelompokan, anotasi jenis sel, gen penanda, dan analisis ekspresi berbeza yang dibuat pada peringkat subjek, bukan setiap sel.
Transkriptomik spatial
Domain spatial, gen berubah mengikut ruang, dekonvolusi terhadap rujukan yang sepadan, statistik kejiranan, dan tindanan yang didaftarkan pada imej tisu.
RNA-seq pukal
Analisis ekspresi berbeza dengan reka bentuk ditulis dahulu, analisis pengayaan, dan rajah yang tidak perlu dilukis semula untuk jurnal.
Integrasi antara sampel
Pembetulan kelompok dengan semakan pembetulan berlebihan yang jelas, kerana integrasi yang nampak cantik tetapi memadam biologi ialah cara paling lazim langkah ini gagal.
Trajektori, kelimpahan, komunikasi
Pseudotime, perbezaan kelimpahan antara keadaan, dan komunikasi antara sel — setiap satu dengan andaian yang mendasarinya dinyatakan dalam laporan.
Jawapan kepada pewasit
Anda hantar komen dan data. Anda terima panel dan statistik khusus yang diminta pewasit, serta nota tentang apa yang berubah pada kesimpulan.
Cara ia berjalan
Empat langkah, dan anda boleh berhenti selepas yang kedua.
Penanda di bawah ialah fail yang benar-benar bergerak antara kita. Tiada apa-apa bermula sebelum harga bertulis ada di tangan anda.
-
.h5ad / .mtx / .csv
Anda hantar apa yang ada
Matriks kiraan, folder keluaran Cell Ranger atau Space Ranger, objek Seurat atau AnnData, atau nombor aksesi data awam. Beritahu kami perbandingan yang ingin anda buat.
-
quote.pdf
Kami hantar skop dan harga
Lazimnya dalam satu hari bekerja: apa yang akan dibuat, apa yang anda terima, harga tetap, dan tarikh penghantaran. Jika reka bentuk anda tidak mampu menyokong perbandingan itu, kami katakannya di sini.
-
qc.log
Kami jalankan, kemudian kami semak
Pemeriksaan yang tetap, bukan ikut rasa: ambang diperoleh daripada data anda, anotasi disahkan terhadap gen penanda, dan perbandingan antara kumpulan diagregatkan ke peringkat sampel sebelum diuji.
-
figures.pdf + .svg + .csv + .R
Anda terima semuanya
Rajah vektor, jadual keputusan, kod yang menghasilkannya, dan perenggan kaedah yang boleh terus ditampal ke dalam manuskrip.
Mengapa ia pantas, dan tetap betul
Automasi buat kerja yang berulang. Ia tidak memutuskan sama ada jawapannya boleh dipercayai.
Saluran kerja, sapuan parameter dan penjanaan rajah semuanya automatik — itulah sebabnya projek standard mengambil beberapa hari dan bukan beberapa bulan, dan sebabnya harga boleh ditetapkan lebih awal. Yang kekal ditimbang oleh manusia ialah setiap titik di mana keputusan yang salah boleh menyelinap masuk ke dalam sebuah makalah.
Ambang datang daripada data anda.
Nilai potong QC diperoleh bagi setiap set data (median ± 3 MAD), bukan disalin daripada tutorial yang ditulis untuk tisu orang lain.
Anotasi disemak terhadap gen penanda.
Sesuatu label hanya dikekalkan jika gen penanda kanonik menyokongnya; kluster yang tidak jelas kekal bernombor dan tidak diberi nama yang kedengaran pasti.
Perbandingan antara kumpulan diagregatkan ke peringkat sampel.
Menguji beribu-ribu sel seolah-olah ia beribu-ribu sampel bebas membesarkan signifikans. Untuk reka bentuk n lawan n, kami buat pseudobulk dahulu.
Integrasi diuji tekanan.
Setiap pembetulan kelompok disemak sama ada ia turut membuang kesan yang sedang anda kaji.
Setiap rajah boleh dihasilkan semula.
Anda terima skrip yang membuatnya, jadi permintaan pewasit "sila lukis semula tanpa sampel 4" hanya mengambil beberapa minit, bukan satu projek baharu.
Harga
Julat yang diterbitkan. Satu angka tetap sebelum kerja bermula.
Julat anggaran dalam USD. Sebut harga bertulis akan jatuh dalam julat ini kecuali data anda memerlukan sesuatu di luar julat — dan dalam keadaan itu kami beritahu sebelum, bukan selepas.
| Perkhidmatan | Anggaran | Unit |
|---|---|---|
| RNA-seq sel tunggal — analisis standard | $380–$650 | setiap sampel |
| Sel tunggal — modul lanjutan | $900–$3,200 | setiap projek |
| Analisis transkriptomik spatial | $550–$1,400 | setiap slaid |
| RNA-seq pukal — ekspresi berbeza | $300–$900 | setiap projek |
| Analisis semula / jawapan kepada pewasit | $450–$1,800 | setiap projek |
Ada data dan ada tarikh akhir?
Beritahu kami jenis data dan perbandingan yang dikehendaki. Anda terima skop bertulis, harga tetap dan tarikh penghantaran — lazimnya dalam satu hari bekerja.