이 서비스는
한 프로젝트 단위로 고용할 수 있는 생물정보 팀입니다.
대부분의 연구실에 필요한 것은 상근 생물정보 인력을 한 명 더 뽑는 일이 아닙니다. 지금 가진 데이터 하나를 결과로 바꾸는 일, 그리고 일정에 넣을 수 있는 납기입니다.
- 시퀀싱 계약 불필요
쓰던 시퀀싱 업체를 그대로 쓰세요
저희는 시퀀싱을 판매하지 않으므로 저희에게서 구매하실 필요가 전혀 없습니다. 어떤 플랫폼, 어떤 업체의 데이터든, 공개 데이터셋이든 받습니다.
- 최소 주문 없음
샘플 하나도 정식 프로젝트입니다
슬라이드 한 장도 마찬가지이고, 만들 시간이 없는 그림 한 장을 요구하는 심사 의견 하나도 마찬가지입니다.
- 시간당 청구 없음
가격은 착수 전에 합의합니다
데이터가 설명과 다른 것으로 밝혀지면 다시 견적을 드리고 답을 기다립니다. 나중에 청구서에 얹지 않습니다.
분석 범위
전사체가 실제로 도착하는 세 가지 형태.
단일세포 RNA-seq
QC와 필터링, 클러스터링, 세포 유형 주석, 마커 유전자. 차등 발현은 세포 단위가 아니라 개체 단위에서 수행합니다.
공간 전사체
공간 도메인, 공간 가변 유전자, 대응 레퍼런스를 이용한 디컨볼루션, 이웃 통계, 조직 이미지에 정합된 오버레이.
벌크 RNA-seq
실험 설계를 먼저 기록한 뒤 수행하는 차등 발현, 농축 분석, 그리고 투고를 위해 다시 그릴 필요가 없는 그림.
샘플 간 통합
배치 보정에는 반드시 과보정 검사를 붙입니다. 보기에는 훌륭하게 통합되었는데 생물학적 차이까지 지워버리는 것이 이 단계에서 가장 흔한 실패이기 때문입니다.
궤적, 구성비, 상호작용
의사시간, 조건 간 세포 구성 차이, 세포 간 상호작용 — 각각이 전제하는 가정을 보고서에 명시합니다.
심사 의견 대응
의견과 데이터를 보내주시면, 심사자가 지목한 그림과 통계, 그리고 결론이 바뀌는지에 대한 견해를 돌려드립니다.
진행 방식
네 단계, 두 번째 이후 언제든 멈추셔도 됩니다.
아래 표시는 실제로 저희와 오가는 파일입니다. 서면 가격을 받아보시기 전에는 아무것도 시작되지 않습니다.
-
.h5ad / .mtx / .csv
가진 것을 보내주세요
카운트 행렬, Cell Ranger 또는 Space Ranger 출력 폴더, Seurat 또는 AnnData 객체, 또는 공개 데이터 접근번호. 하시려는 비교도 함께 알려주세요.
-
quote.pdf
범위와 가격을 보내드립니다
보통 1 영업일 이내. 무엇을 할지, 무엇을 받으실지, 고정 가격, 납기를 명시합니다. 실험 설계가 그 비교를 뒷받침하지 못하면 이 단계에서 말씀드립니다.
-
qc.log
실행하고, 저희가 검증합니다
감이 아니라 정해진 체크포인트로. 임계값은 보내주신 데이터에서 도출하고, 주석은 마커로 대조하며, 군 간 비교는 검정 전에 샘플 단위로 집계합니다.
-
figures.pdf + .svg + .csv + .R
전부 돌려드립니다
벡터 그림, 결과 표, 그것을 만든 코드, 그리고 원고에 바로 붙일 수 있는 Methods 문단.
왜 빠르면서도 정확한가
자동화는 반복 작업을 맡습니다. 답이 믿을 만한지는 자동화가 정하지 않습니다.
파이프라인, 파라미터 탐색, 작도는 자동화되어 있습니다. 표준 프로젝트가 달이 아니라 날 단위로 끝나는 이유이자, 가격을 미리 고정할 수 있는 이유입니다. 사람이 계속 판단하는 것은, 잘못된 결정이 조용히 논문까지 살아남을 수 있는 모든 지점입니다.
임계값은 보내주신 데이터에서 나옵니다.
QC 컷오프는 데이터셋마다 도출합니다(중앙값 ± 3 MAD). 남의 조직을 위해 쓰인 튜토리얼에서 베끼지 않습니다.
주석은 마커로 대조합니다.
표준 마커가 뒷받침할 때만 라벨을 남깁니다. 분리되지 않는 클러스터는 확신에 찬 이름 대신 번호로 남겨둡니다.
군 간 비교는 샘플 단위로 집계합니다.
수천 개의 세포를 수천 개의 독립 표본처럼 검정하면 유의성이 부풀려집니다. n 대 n 설계에서는 먼저 의사벌크로 만듭니다.
통합은 스트레스 테스트를 거칩니다.
모든 배치 보정에 대해, 연구하시는 효과까지 함께 지우지 않았는지 확인합니다.
모든 그림은 재현 가능합니다.
그림을 만든 스크립트를 함께 드립니다. 심사자의 "샘플 4를 빼고 다시 그려주세요"가 새 프로젝트가 아니라 몇 분의 작업이 됩니다.
가격
구간은 공개하고, 착수 전에 하나의 고정 금액을 드립니다.
아래는 미국 달러 기준 참고 구간입니다. 서면 견적은 이 구간 안에 들어옵니다. 데이터가 이 구간이 다루지 못하는 것을 필요로 할 때만 예외이며, 그 경우 착수 후가 아니라 사전에 말씀드립니다.
| 서비스 | 참고 가격 | 단위 |
|---|---|---|
| 단일세포 RNA-seq — 표준 분석 | $380–$650 | 샘플당 |
| 단일세포 — 심화 모듈 | $900–$3,200 | 프로젝트당 |
| 공간 전사체 분석 | $550–$1,400 | 슬라이드당 |
| 벌크 RNA-seq — 차등 발현 | $300–$900 | 프로젝트당 |
| 재분석 / 심사 의견 대응 | $450–$1,800 | 프로젝트당 |
데이터와 마감일이 모두 있으신가요?
데이터 종류와 하시려는 비교를 알려주세요. 서면 범위와 고정 가격, 납기를 돌려드립니다 — 보통 1 영업일 이내에.