บริการนี้คืออะไร
ทีมชีวสารสนเทศที่คุณจ้างได้เป็นรายโครงการ
ห้องปฏิบัติการส่วนใหญ่ไม่ได้ต้องการนักชีวสารสนเทศประจำเพิ่มอีกหนึ่งคน แต่ต้องการให้ข้อมูลชุดหนึ่งที่มีอยู่กลายเป็นผลลัพธ์ ภายในวันที่วางแผนล่วงหน้าได้
- ไม่ต้องทำสัญญาหาลำดับเบส
ใช้ผู้ให้บริการหาลำดับเบสรายเดิมต่อไปได้
เราไม่ขายบริการหาลำดับเบส จึงไม่มีเหตุให้ต้องซื้อจากเรา รับข้อมูลจากทุกแพลตฟอร์ม ทุกผู้ให้บริการ รวมถึงชุดข้อมูลสาธารณะ
- ไม่มีขั้นต่ำ
ตัวอย่างเดียวก็เป็นโครงการจริง
สไลด์เดียวก็เช่นกัน หรือความเห็นผู้ประเมินเพียงข้อเดียวที่ต้องการรูปซึ่งคุณไม่มีเวลาทำ ก็นับเป็นโครงการเช่นกัน
- ไม่คิดค่าบริการรายชั่วโมง
ตกลงราคากันก่อนเราเริ่มงาน
หากข้อมูลจริงต่างไปจากที่อธิบายไว้ เราจะเสนอราคาใหม่และรอคำตอบจากคุณ ไม่ใช่ไปเพิ่มยอดในใบแจ้งหนี้ภายหลัง
ขอบเขตการวิเคราะห์
ข้อมูลทรานสคริปโตมในสามรูปแบบที่มาถึงมือจริง
Single-cell RNA-seq
QC และการกรอง การจัดกลุ่ม การกำกับชนิดเซลล์ ยีน marker และการวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างซึ่งทำในระดับตัวอย่าง ไม่ใช่ระดับเซลล์
Spatial transcriptomics
โดเมนเชิงพื้นที่ ยีนที่แปรผันตามตำแหน่ง การทำ deconvolution เทียบชุดอ้างอิงที่สอดคล้อง สถิติความเป็นเพื่อนบ้าน และภาพซ้อนทับที่จัดตำแหน่งตรงกับภาพเนื้อเยื่อ
Bulk RNA-seq
การวิเคราะห์การแสดงออกที่แตกต่างโดยเขียนแบบแผนการทดลองให้ชัดก่อน การวิเคราะห์การเพิ่มพูน และรูปที่ไม่ต้องวาดใหม่ตอนส่งวารสาร
การรวมข้อมูลข้ามตัวอย่าง
การแก้ไข batch พร้อมการตรวจสอบการแก้ไขเกินจำเป็นอย่างชัดเจน เพราะการรวมข้อมูลที่ดูสวยงามแต่ลบความแตกต่างทางชีววิทยาไปด้วย คือความผิดพลาดที่พบบ่อยที่สุดในขั้นตอนนี้
Trajectory สัดส่วน และการสื่อสาร
Pseudotime ความแตกต่างของสัดส่วนเซลล์ระหว่างเงื่อนไข และการสื่อสารระหว่างเซลล์ โดยระบุข้อสมมติที่แต่ละอย่างตั้งอยู่ไว้ในรายงาน
การตอบความเห็นผู้ประเมิน
คุณส่งความเห็นและข้อมูลมา คุณจะได้รูปและค่าสถิติที่ผู้ประเมินระบุถึงโดยตรง พร้อมข้อสังเกตว่าข้อสรุปเปลี่ยนไปหรือไม่
ขั้นตอนการทำงาน
สี่ขั้นตอน และคุณหยุดได้หลังขั้นที่สอง
เครื่องหมายด้านล่างคือไฟล์ที่ส่งกันจริงระหว่างเราสองฝ่าย จะไม่มีอะไรเริ่มขึ้นจนกว่าคุณจะได้ราคาเป็นลายลักษณ์อักษรอยู่ในมือ
-
.h5ad / .mtx / .csv
คุณส่งสิ่งที่มีอยู่มา
เมทริกซ์นับ โฟลเดอร์ผลลัพธ์จาก Cell Ranger หรือ Space Ranger ออบเจกต์ Seurat หรือ AnnData หรือหมายเลข accession ของข้อมูลสาธารณะ พร้อมบอกเราว่าต้องการเปรียบเทียบอะไร
-
quote.pdf
เราส่งขอบเขตงานและราคากลับไป
ปกติภายในหนึ่งวันทำการ ระบุว่าจะทำอะไร คุณจะได้อะไร ราคาคงที่เท่าไร และส่งมอบวันไหน หากแบบแผนการทดลองของคุณรองรับการเปรียบเทียบนั้นไม่ได้ เราจะบอกในขั้นตอนนี้
-
qc.log
เรารัน แล้วตรวจซ้ำเอง
จุดตรวจที่กำหนดไว้ตายตัว ไม่ใช่ตัดสินตามความรู้สึก ค่าตัดมาจากข้อมูลของคุณเอง การกำกับชนิดเซลล์ตรวจสอบกับยีน marker และการเปรียบเทียบระหว่างกลุ่มรวมข้อมูลขึ้นสู่ระดับตัวอย่างก่อนทดสอบทางสถิติ
-
figures.pdf + .svg + .csv + .R
คุณได้ทุกอย่างกลับไป
รูปแบบเวกเตอร์ ตารางผลลัพธ์ โค้ดที่สร้างผลเหล่านั้น และย่อหน้าวิธีการที่วางลงในต้นฉบับได้ทันที
ทำไมจึงเร็วได้ โดยยังถูกต้อง
ระบบอัตโนมัติรับงานส่วนที่ทำซ้ำ แต่ไม่ได้เป็นผู้ตัดสินว่าคำตอบน่าเชื่อถือหรือไม่
ไปป์ไลน์ การกวาดค่าพารามิเตอร์ และการสร้างรูป ล้วนเป็นระบบอัตโนมัติ นั่นคือเหตุผลที่โครงการมาตรฐานนับเป็นวันไม่ใช่เป็นเดือน และเป็นเหตุผลที่กำหนดราคาไว้ล่วงหน้าได้ ส่วนที่ยังคงใช้คนตัดสินคือทุกจุดที่การตัดสินใจผิดจะเล็ดลอดเงียบ ๆ เข้าไปอยู่ในบทความ
ค่าตัดมาจากข้อมูลของคุณเอง
ค่าตัด QC คำนวณจากแต่ละชุดข้อมูล (มัธยฐาน ± 3 MAD) ไม่ได้ลอกจากบทเรียนที่เขียนไว้สำหรับเนื้อเยื่อของคนอื่น
การกำกับชนิดเซลล์ต้องตรวจกับ marker
เก็บป้ายกำกับไว้เฉพาะเมื่อยีน marker มาตรฐานสนับสนุน กลุ่มที่ยังแยกไม่ชัดจะคงเป็นหมายเลขไว้ ดีกว่าตั้งชื่อที่ฟังดูมั่นใจ
การเปรียบเทียบระหว่างกลุ่มรวมขึ้นสู่ระดับตัวอย่าง
การทดสอบเซลล์หลายพันเซลล์ราวกับเป็นตัวอย่างอิสระหลายพันตัวอย่าง จะทำให้ค่านัยสำคัญพองเกินจริง สำหรับการออกแบบแบบ n ต่อ n เราทำ pseudobulk ก่อน
การรวมข้อมูลต้องผ่านการทดสอบความทนทาน
การแก้ไข batch ทุกครั้งจะถูกตรวจว่าได้ลบผลกระทบที่คุณกำลังศึกษาไปด้วยหรือไม่
ทุกรูปทำซ้ำได้
คุณจะได้สคริปต์ที่สร้างรูปนั้นด้วย คำขอของผู้ประเมินที่ว่า "กรุณาวาดใหม่โดยตัดตัวอย่างที่ 4 ออก" จึงใช้เวลาไม่กี่นาที ไม่ใช่กลายเป็นโครงการใหม่
ราคา
เปิดเผยช่วงราคา แล้วให้ตัวเลขคงที่ก่อนเริ่มงาน
ช่วงราคาโดยประมาณเป็นสกุลดอลลาร์สหรัฐ ใบเสนอราคาที่เป็นลายลักษณ์อักษรจะอยู่ในช่วงนี้ เว้นแต่ข้อมูลของคุณต้องการสิ่งที่ช่วงราคานี้ไม่ครอบคลุม ซึ่งกรณีนั้นเราจะแจ้งก่อน ไม่ใช่แจ้งทีหลัง
| บริการ | ราคาโดยประมาณ | หน่วย |
|---|---|---|
| Single-cell RNA-seq — การวิเคราะห์มาตรฐาน | $380–$650 | ต่อตัวอย่าง |
| Single-cell — โมดูลขั้นสูง | $900–$3,200 | ต่อโครงการ |
| การวิเคราะห์ spatial transcriptomics | $550–$1,400 | ต่อสไลด์ |
| Bulk RNA-seq — การแสดงออกที่แตกต่าง | $300–$900 | ต่อโครงการ |
| การวิเคราะห์ซ้ำ / การตอบความเห็นผู้ประเมิน | $450–$1,800 | ต่อโครงการ |
มีข้อมูลอยู่แล้ว และมีกำหนดส่งใช่ไหม
บอกเราว่าเป็นข้อมูลประเภทใดและต้องการเปรียบเทียบอะไร คุณจะได้ขอบเขตงานเป็นลายลักษณ์อักษร ราคาคงที่ และวันส่งมอบ ปกติภายในหนึ่งวันทำการ